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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗体阳性种类炎症因子朋友、寡核苷酸修饰语价格过高或操作方法流量较为复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯讲解人员在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低资金、跨种群、全系统兼容的全新解决方案。

期刊论文简洁

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我国的小学科高校隔代基因遗传病性与成长海洋生物技术工程学探析所和我国的隔代基因遗传病性自学主办者的全国学术界讨论杂志杂志,着力推进于报道范文生命的意义小学海洋生态学和医学检验隔代基因遗传病性学范围的原创度性探析成绩。JGG 2021年度反应因素7.1,Scopus学术界讨论杂志杂志评述完成指标CiteScore 9.9,位居JCR 2021年度GENETICS & HEREDITY范围Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY范围Q1区,位居我国的小学科高校杂志杂志区域海洋生物技术工程学个类别1区(Top杂志杂志),隔代基因遗传病性学和生物技术化与大分子海洋生物技术工程学小类双1区。

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啥子是HEATag

巧用的“二一体化”设计构思

HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成部分的融为一体血清

「产品定位器」功能 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化绘制(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「连入器」控制器 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)目录长商品条形码来进行共价链接。

“1+1>2”的治疗效果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行范例标上与溯源系统。

Fig1: HEATag多沉标签设计原理关心图

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实战技巧检定

HEATag算是有可以打?

都可以在有差异状况下,变现喂母乳甲壳动物受损神经元系单受损神经元混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。深入分析人员为 HEATag 设施了多轮 “水压测试方法”,从细胞系系系到细胞系系核,从超恒温到恒温,从新鲜样版到统一样版,全座向检验它的相对稳确定和是真的吗性。

首个轮软件测试针对性母乳喂奶動物血癌肿瘤细胞系:研究浅析职工首选了源自人、鼠、仓鼠三种种类的五种血癌肿瘤细胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在常温下要 HEATag 标识后混合物测序。决定性二手回收的 11447 个血癌肿瘤细胞中,85.66% 都能利用 HEATag 条型码合理匹配好到原种类,样版间交叠空气污染特少,UMAP 聚类浅析浅析更之间证明信,HEATag 条型码与种类特女性朋友dna组表现相对高度同一。 立刻,测试测试要求进第一步晋级:科研想关人员来尝试在 4℃下标价签剥好上皮组织组织、在高温下标价签甲醇确定不变上皮组织组织,甚至会直观标价签上皮组织组织核。后果即使全场最佳:各种要求下,模本标价签与种类想关信息均具备着很不错的想关性,转换更准率超 95%。就算甲醇确定不变会造成的不严重的转录本交差严重污染,上皮组织组织核制得能有一少部分 RNA 外流,上皮组织组织业务类型的参考文献标注后果即使与剥好模本恢复不对,证件 HEATag 需要标价签有所差异处置要求下的实验报告模本。

Fig2: HEATag 可在各个状态下成功单组织细胞转录组混样具体分析

并能标签辅乳甲壳两栖动物和浅海无脊梁骨甲壳两栖动物的原代細胞

要是说神经受损细胞系测试英文是 “核心题”,那企业样例可是 “额外题”, 等等样例并不因神经受损细胞种类错综复杂、室内环境习惯性个性化,拥有符号技术设备的 “薄弱环节”,而 HEATag 恰恰舞在等等 “薄弱环节” 上展示了优越。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组织安排,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞这不仅能被精确鉴别,一切最主要的受损细胞的类型的聚类算法报告都清析可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海底菌物的兼容性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与种群转录组有较高不对性,找不到冒出因高盐室内环境造成 的 “标注不能正常工作”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可控制喂母乳绿色组织安排样品众多 scRNA-seq 深入分析

Fig4: HEATag可做到鲜活海上无脊柱部分动物许多 scRNA-seq 概述

HEATag与组织细胞的融合不易引发转录组的相关系数提升

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在做完箭头任何的也,不用对之后的转录类物质析引起要素,担保了钻研数据文件的真人真事性。

Fig5: HEATag不容易不良影响模本的 RNA 描述的模式

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末来可期

HEATag 能为单组织细胞探析造成之类?

HEATag 的价值量,远不绝于 “化解标记符号情况”,它的灵生物性和共通性,将要为单生殖细胞的研究点开越来越多将会性

从使用场合来说

HEATag 能覆盖率从 “简约是比较分折”(如癌安排与正常的安排、药剂工作与参考)到 “大经营总量理论分析”(如安排細胞图谱制图、高通骁龙量挑选)的全的范围各种需求。逐渐 PIP-seq、Stereo-cell 等新兴可拓张技術的的发展,HEATag 还能进的一步大幅提升单細胞理论分析的通量,助力器科研管理公司抓好更广经营总量的内容。

从跨各个领域优势看你

HEATag 并不是不适使用于转录组学,还能与表观表观遗传组学、蛋白酶质组学、办公空间组学等系统切合,完成制作数据库索引和寡核苷酸字段,HEATag 也能能快速加入不同的的组学方案,不危害数据信息驯服层次。一同,应用于HEATag还也能能提升单人体细胞糖组学科研系统。

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媒体合作日常动态

拜谱生物技术与陈凯博士生导师确立进行初步加盟想法

最该瞩目的是,在 HEATag 工艺水平设备能够 出庞然大物应该用实力的游戏背景下,拜谱海底微生物工程已与我国南方海底有效与水利工程福建调查室设计室(武汉)陈凯专家形成进行的合作项目合作。男女双方计划书着眼于 HEATag 工艺水平设备的产业群化出台、科技论述转换等方面刺激性广度警税,带动这样低利润、跨种类的单受损肿瘤组织细胞图标工艺水平设备更加迅速应该用于具体情况科技论述场地,为越来越多调查室设计室展示 高效能、市场经济的单受损肿瘤组织细胞论述产品,助推科技论述岗位者在受损肿瘤组织细胞海底微物理学、海底海底微物理学、问题新机制等方面要先拿到越来越多超过
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