草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿体统常用见的疫情其一。肾组织结构中CaOx晶状体过饱满沉淀积累会会影响肾小管受损细胞伤害和凋亡，才能会影响肾结石的达成。短链蛋白质堆积酸由肠子内好氧池真菌沤肥营养健康植物纤维呈现，往往在部位肠子障壁中充分调动反应，并且在体统技术水平上也充分调动关健反应。至少，丁酸是最充足的短链蛋白质堆积酸，具抗感染和抗体克制反应,本科学研究研讨丁酸对CaOx肾结石的反应名词解释潜在的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山宠物医院泌尿内科吴忠医学博士生导师、周子健医学博士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教学、周子健医生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物制品与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网络信息药剂学学服务的，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

稿件种类：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 买家的单位：华山专科医院 研究方案對象：大鼠、HK-2癌细胞 分组进行资讯：照表组（Con）、建模方法组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱具备新技术：网路药剂学学检侧

基本思路方案图

研究方案的结果

分析方案考生最先建立大鼠模板，在生理问题生物化学指数公式和组织安排病症学染色法等分析方案的手段会发现丁酸应该下降CaOx模板大鼠肾CaOx单晶体的养成和断裂，改进CaOx模板大鼠的真菌感染断裂和腐蚀材料的频繁表现。另外，丁酸还可以抑制性草酸诱导性的HK-2血细胞系断裂、腐蚀应激反应和血细胞系凋亡。 为探讨丁酸组成部分和靶表观遗传网格数据研究阐述报告信息，研究方案人士从PubChem收集丁酸和丁酸酯的二维和三维空间组成部分（图1A）。根据PharmMapper数据研究阐述报告信息库和Uniprot数据研究阐述报告信息库加工处理后共选择出11九个丁酸靶表观遗传供进三步深入研究阐述。将表观遗传文件列表添加STRING数据研究阐述报告信息库，展开PPI网格数据研究阐述报告信息深入研究阐述。Cytoscape提出了顺序排列的前20的联络线靶表观遗传的详细阐述网格数据研究阐述报告信息图，涉及到CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。他们联络线表观遗传与网格数据研究阐述报告信息中的另外表观遗传均体现出有一定的对应性，阐述他们表观遗传应该展现出着融合的效果。GO和KEGG深入研究阐述意味着了丁酸联络线表观遗传的对应有效前提条件和微生态学系统（图1C）。联络线表观遗传其主要是与类固醇热血素类初次回话、防被氧化应激状态状态初次回话、渗透性氧細胞对类固醇热血素类热血的发生发应各类对呈酸性无机化学有机化合物的发生发应有关。总而言之根据上述，他们联络线表观遗传其主要是组织了防被氧化应激状态状态和对渗透性氧的微生物体发生发应过程中 ，是肾结石进行体制中至关注重的有效前提条件，这意味着丁酸应该在肾结石中展现出注重的效果。

图1| 丁酸的结构与靶dna电脑网络定量分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进的一步不断探索丁酸对CaOx肾结石确凿切靶表观遗传，实验师实施GEO数剧库对GSE73680中健康生活参考与CaOx肾结石提高的表观遗传一定的差异实施了实验。参考组与CaOx结石提高的偏态性一定的差异表答表观遗传（DEGs）人类什么是遗传dna遗传检测标准规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个表观遗传发生了偏态发展，进来3379个（89.4%）表观遗传表答调涨，404个（10.6%）表观遗传表答调整（图2A）。对DEGs实施聚类分析法算法数据分析分析，热图展现了前10个被选中DEGs的二维细化聚类分析法算法特色（图2B）。很快，实验师确认GeneCards数剧库人工客服电话鉴别了370个有机会与CaOx肾结石相关的的的表观遗传，关键性词排名前20位的推测表观遗传试述相关的的性得分如图所显示2C所显示。考虑到遇到丁酸治疗方法CaOx肾结石的关键性靶点，实验师将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相关的的表观遗传清理得出打了个个Venn图。不可能，CYP2C9被判定为丁酸反应CaOx肾结石的因素靶点(图2D)。于此，实验师还实施了丁酸与CYP2C9的原子连接，CYP2C9的5个胺基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸能够 角色，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在灵活运用系统药理学学分折CYP2C9是丁酸导致CaOx肾结石的靶DNA后，的研究工人还用上皮受损细胞测试证明了CYP2C9可调低草酸引诱的HK-2上皮受损细胞的ROS水平方向、感染磨损和凋亡。

图2| 绝大多数据库整合研究分析分析CYP2C9是丁酸反应于CaOx肾结石的靶基因组

研发毕竟

本探析第一看到丁酸在身体之外和体内的均能缓和CaOx肾结石整治的腐蚀反应应激状态反应和疾病板材损害，末尾可以能够 网洛药学学需求得以丁酸不良影响CaOx肾结石的自身靶点——CYP2C9，末尾可以能够 癌神经细胞实验操作得知CYP2C9在草酸盐诱惑的HK-2癌神经细胞ROS含量、疾病板材损害和凋亡。等看到证明丁酸已经可以能够 缓和CYP2C9来缓和CaOx肾结石的腐蚀反应应激状态反应，减弱疾病板材损害。此环节中拜谱生物学体挺高了网洛药学学能力工艺安全业务，除此之外拜谱生物学体可挺高完美落实的染色体组学、蛋清质组学、分泌组学等几组学车辆及能力工艺安全业务，欢迎图片呼叫顾问！ 参考使用学术论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.