
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
理论研究可是
实验相关人员探究式由于冷冻箱时候加长牛羊肉片的洛氏光洁度、持水、成色、氧化的钙纯度铁纯度、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4水平方向来风险评估力量企业体组织的铁死忙方式。效果界面显示,冷冻箱时候加长后,牛羊肉片的洛氏光洁度在第5天和第6天更为明显下滑;持水工作能力降底;色变深,消失光滑,鲜粉红转成暗粉红。因此,氧化的钙纯度铁、催化活性氧和MDA的纯度更为明显延长,体组织凋亡率更为明显身高。 探索成员转化成区别保鲜的时间的肌肤供试品的蛋清质,接着通过SDS-PAGE分析一下一下,蛋清质条带在区别朝代数据分布饱满且相同(图1a)。依据蛋清在区别供试品中的形容条件,分析一下一下知道某个组供试品的中五位数取决于于某个级别(图1b),这说明肌肤供试品蛋清质具备有顺畅的组内相同性和组间不同之处性。 球血清酶质组学共检测出1996种球血清酶质。以B0为比组,需求B1、B2、B4和B6中的球血清酶对其进行区别之处把你想表达爱出来爱进行具体分析,共检测到375个DEPs。将火山图交互,并因为FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两大标准化进行具体分析DEP。数据就像文中1c-f如图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别检测出22、33、73和140个DEPs,当中别调整6、11、32和85个,下跌16、22、41和52。聚类分析法方式监测了区别要在冷藏室保存过程腿部肌肉群企业中球血清酶质的把你想表达爱出来爱,数据提示 腿部肌肉群球血清酶把你想表达爱出来爱区别之处因为保管的时间的提升而提升(图1g)。
图1| 各种冷库日子的力量原辅料血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有一定的差异 冷冻冷藏用时的肌肉组织样板一定的差异蛋清分享(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁消失血清肽的PRM参考值定性分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依托于KEGG含有对比分析表答淀粉酶的铁消失新机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱海洋生物提供了TMT化学发光法淀粉酶酶质组学系统服务性保障,拜谱怪物已研发团队完工并建造了更加完善成熟期的转录组学、淀粉酶酶组学、消化吸收组学已经多个学联合技巧货品系统服务性保障组织体制,欢迎致电咨询!
考虑资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.